【ChinaByte 报道】(2001年2月19日,北京) 为生命科学登月计划提供超级计算动力康柏电脑公司,在生命科学领域已 备受关注。

  日前,康柏推出了业界最强大微处理器——64位主频高达833MHz Alpha微处理器,并宣布已经成功为下一代基因研究准备了所需要的强大计算动 力。康柏Alpha微处理器早已在科学与商业市场领域创下了一系列性能标准。配 置了新的0.18微米Alpha微处理器康柏AlphaServer ES40已经在一个多月前正式 面向用户推出,并在Oracle和SAP的一系列基准性能测试中创造了最高成绩。 AlphaServer最早的用户之一赛莱拉公司基础设施技术副总裁Marshall Peterson先生说:“康柏的AlphaServer技术是我们加速人类基因组排序工作中不 可或缺的一个组成部分,它把我们乐观预计的研究时间足足缩短了两年。我们的 基准测试显示,新Alpha处理器使系统性能水平提高了72%。这些采用新处理器 的AlphaServer系统将进一步加速我们在生命科学领域的重要研究工作的进程。”

  2001年1月12日,赛莱拉公司在华盛顿举办的一个仪式上正式宣读了已发表的 关于世界上第一个完整的关于人类基因组草图的论文,研究结果表明人类基因总 数为3万个左右,为人类医学新发展提供了崭新的、激动人心的前景。在人类基 因组排序的过程中,赛莱拉公司完全依赖运行Tru64 UNIX操作系统和TruCluster 软件的康柏AlphaServer系统对超过70TB的数据进行管理,完成了多项人类超级 计算史上最为复杂的计算工作。塞莱拉公司测定的基因序列覆盖了95%以上的人 类基因组,它的核心分析方法被称为“霰弹法”,而人类基因工程则采用了“克 隆法”。霰弹法是一个高度计算机化的方法,它是先把基因组随机分成已知长度 的片段,然后用数学算法将这些片段组装成毗邻的大段并确定它们在基因组上的 正确位置。

  克隆法则是先复制大段的人类基因序列,然后将它们绘制到基因组的 适当区域,这种方法需要研究人员在早期把更多的时间和精力放在克隆和绘制草 图上。而塞莱拉公司的霰弹法则是后期需要做大量的计算工作,因此,塞莱拉公 司需要全球最为强大的超级计算动力,而正式因为康柏AlphaServer的加入,使 塞莱拉如虎添翼,并对AlphaServer最新产品寄予厚望。

  同时,美国国家能源部Sandia国家实验室、赛莱拉公司和康柏公司计划到2004 年,他们将联手开发出新一代的超级计算机。而这个项目的初始技术平台将采用 配置有新833MHz微处理器的AlphaServer ES40系统。这个处理速度高达每秒100 万亿次(100 TeraOPS)的超级计算机将被用于开发生物研究计算领域所需要的软 件和计算机硬件解决方案以及各种各样的生命科学研究适用的应用。 康柏公司高性能服务器部副总裁Don Harbert先生说:“今天的发布进一步证 明我们有能力为全球科学和商业市场中的用户提供基于各种新产品的集成解决方 案,充分满足最密集处理的需要。

  由于我们对提供高性能企业计算解决方案的高 度专注,我们的AlphaServer系统收入正以每年20%的速度持续增长着,而我们 UNIX操作系统的增长速度也突破了30%,是业界平均水平的两倍多。”

  下面,我们来看一下AlphaServer ES40系统的优势。对于那些CPU密集型应 用,如数据挖掘数据分析的用户来说,AlphaServer ES40系统提高的性能对他 们有着极大的吸引力,它能够提供最新的供应链示意图、商业趋势分析图和客户 关系管理数据。更快的数据更新和分析能力能够为用户提供更精确的业务认识, 从而有利于人们更及时地作出更具商业价值的决策。这类商业应用程序中的大部 分都使用单一数据流,通过功能强大的处理器都能够对之进行最有效的处理。

  AlphaServer ES40系统支持康柏Tru64 UNIX、OpenVMS和Linux等操作系 统。Tru64 UNIX 和 OpenVMS集群技术,再加上AlphaServer ES40系统本身所 具有的可用性特点,从而确保了这一系统的高可用性,以及显著的易管理性。 采用新Alpha处理器的AlphaServer ES40系统在Oracle应用程序基准测试、 SAP商业信息仓库基准测试和SPEC CPU2000工业标准基准测试创造了各个新标 准。SPECint2000 值是 544, SPECfp值是658。在针对4处理器系统而进行的 SPECfp_rate2000测试中,康柏ES40系统比来自SGI惠普、IBM和Sun等公司 的同类系统要快1.5到2.3倍不等。 配置833MHz处理器和32GB内存的AlphaServer ES40系统以4536名用户和 1.23秒的响应时间创下了新的Oracle应用程序基准测试记录,这一成绩是参赛的 其他服务器所能达到的最高性能水平的两倍还要多。它充分证明,康柏的 AlphaServer 平台与运行在Oracle 8i数据库上的Oracle电子商务包相结合,能够 焕发出巨大的威力,为用户提供无与伦比的电子商务性能。

  在SAP商业信息仓库基准测试中,配置有新微处理器和8GB内存、运行Tru64 UNIX操作系统和Oracle 8i数据库软件的AlphaServer ES40系统同样也创下了新 的中档系统记录。AlphaServer ES40在加载阶段平均吞吐量为每小时2500万线, 在重新调整阶段为1亿6800万线,以及每小时超过46000个查询导航步骤。对 于那些要以超凡的价格性能比配置在中档服务器上运行高强度商业智能应用的组 织来说,AlphaServer系统完全有能力满足他们的需要。最近,康柏的AlphaServer GS320系统又在SAP商业信息仓库基准测试中创下了高档服务器的新纪录。