美国当地时间6月28日，上诉法庭对微软垄断案作出了判决，对阵双方的新闻分析家都宣称己方获得了胜利。而不管怎样，在这个反垄断历史上具有里程碑意义的案件审理过程中，只有法官托马斯· 杰克逊肯定是输家。
美国哥伦比亚特区上诉法庭将杰克逊法官清除出了本案件审理。然后宣布他去年作出的微软一分为二的判决无效，从而为重新审理此案件铺平了道路。除了判决本身对案件产生的影响之外，法庭的还对杰克逊法官作出了很严厉的责难。
在周四的这份记载上诉法官们对案件审理意见的20页文件中，杰克逊因为其在法庭之外的言论而受到激烈批评。其中这样写道：“我们撤消该判决的原因是，承审法官在审理案件过程中，未经允许单方面同《纽约时报》和《纽约人》等媒体举行了秘密会见，并在法庭之外的这些声明中，对微软官员作出了很多具有攻击性的评论，显现出该法官对案件双方具有不平等的偏好性。尽管我们没有发现他持有偏见的确切证据，但是我们认为该承审法官已经严重违犯了诉讼程序，影响了司法过程的正直性。”目前杰克逊还没有对此作出反应。但知情人表示，他不会对上诉法庭的声明感到非常诧异。
而且，杰克逊除了作出了对微软的对立评论之外，还批评了法庭以前在一起有关微软公司的案件中的表现。他曾表示，他对微软再度违反承诺协议（consent-decree）中的禁令感到恼怒。而上诉法庭认为，不管这种攻击性是强烈的或是轻微的，都无关痛痒，上诉判定要求的就是遵守，而不是协议，可以论斤两。法律规定，法官可以公开谈论审理程序上的问题，但是绝对禁止谈论尚未判决的案件相关的法律事实和法理，也不能召开跟案件相关的，但没有案件各方同时参加的会见。
从很多方面看上诉法庭的声明，都有一种积蓄了数年怒火，终于喷发的火山的感觉，这是对杰克逊多年以来在法庭内外所作出的争议性言辞的回报。上诉法官们认为杰克逊应该被清除出案件审理，他故意的、反复的、公然不经许可向新闻界透露了很多案件深层次的中心问题。
Pillsbury Winthrop的主席，反垄断专家Mary Cranston认为，对Jackson的清除行为是“对低级别法官的不寻常的一次非难行为”。但他同时指出，许多法律界人事会对此决定对司法行为的指导意义表示欢迎。她还表示，上诉法庭的这次行动将可能会导致微软案件重新审理。
