康柏高性能计算部生物科学与化学技术高级顾问布鲁斯.福斯特博士近日来京,向新闻媒体和中国用户全面介绍了全球的热点话题之一——基因工程的方方面面,使中国用户在基因工程的基础上对高性能计算以及AlphaServer有了一个全新的认识。布鲁斯博士是生物化学专家,曾是康柏第一台超级计算机康柏AlphaServer SC的产品经理,迄今已在康柏工作了19年的时间。他本人一直在跟踪康柏的基因项目,对基因工程与高性能计算有着绝对的发言权......
】蛋馗咝阅芗扑悴可锟蒲в牖Ъ际醺呒豆宋什悸乘?.福斯特博士近日来京,向新闻媒体和中国用户全面介绍了全球的热点话题之一——基因工程的方方面面,使中国用户在基因工程的基础上对高性能计算以及AlphaServer有了一个全新的认识。布鲁斯博士是生物化学专家,曾是康柏第一台超级计算机康柏AlphaServer SC的产品经理,迄今已在康柏工作了19年的时间。他本人一直在跟踪康柏的基因项目,对基因工程与高性能计算有着绝对的发言权。
专家们强调:IT技术在生物科学中有着至关重要的作用。人类基因组计划本来需要15年的时间,由于科技的不断进步,时间一再缩短,最后提前到2000年6月26日发布。而 AlphaServer是人类基因工程的关键设施之一。AlphaServer是康柏全新品牌战略-灵感科技的重要组成部分,帮助用户完美地表现灵感,成为科技创新的原动力。基因工程一直是全球关注的热点之一,而灵感科技在基因工程中得到了完
美的阐释。基因组计划使人们全面认识了高性能计算,也对康柏公司的 Alpha技术有了更深的了解。
《福布斯》杂志指出,人类基因组草图的竞争已经结束,康柏是真正的赢家,至少从计算的角度而言是这样。
完成人类基因草图绘制的三个重要参与者塞莱拉公司、Sanger中心、怀特研究院都无一例外地选择康柏作为唯一的IT合作伙伴。塞莱拉公司负责IT基础设施的副总裁Marshall 说:“为什么我们使用康柏运行Tru64 Unix的Alpha系统?答案很简单:我们准备了一个基准测试,把它交给了所有的厂商。只有两家能运行它。其中一家花了87小时,而康柏只用了7小时。” 塞莱拉公司的系统包括超过150台四路
服务器ES40(4个EV6/67
处理器、2~32GB的
内存)、10台 DS20(2个EV67处理器、2GB内存)和一台GS160(16个EV67处理器、64GB内存),以及7台GS140 (6~10个EV6处理器、4~32GB内存)。为了容纳所有数据,赛莱拉公司配备了大约80TB(即80万亿字节)的康柏StorageWorks存储产品、6台ESL9000
磁带库和7台TL895,它的数据库正以每日近 20GB或者每年9TB的速度迅速增长着。塞莱拉公司的组合定位计算涉及到5亿万亿次碱基对的对比工作,这是一项需要花费2万多个小时超级计算的庞大任务。这对IT技术提出了严峻的挑战。